У Minecraft точкою відліку є рівень корінної породи, який приймається за нульовий. Рівень моря – 63, а найвищий шар, який доступний у грі, – 256 блоків з вертикалі. Зокрема нижня грань нижнього блоку корінної породи має Y координату 0. Цей блок, відповідно, знаходиться в нульовому шарі.
Офіційно, Minecraft використовується метрична система, і кожен блок дорівнює одному кубічному метру. Щоб виміряти великі відстані, можна просто поставити смолоскип або будь-яку іншу позначку через кожний десятий блок, а через кожні десять міток — подвійну мітку. Після десяти таких міток можна отримати кілометр.
256 Максимальна висота збільшена зі 128 до 256, завдяки чому можна будувати на поверхні над корінною породою в Нижньому світі.
Генерація світу Збільшено межі будівництва та генерації на 64 блоки вгору та 64 блоки вниз. Загальна висота становить 384 блоки. Підземні блоки, споруди та печери генеруються до глибини Y=-64.